Vodu z Mlynické doliny odvádí potok Mlynica, který pádem ze skalní římsy vytváří cíl naší dnešní túry – vodopád Skok.
Mlynica je přítokem řeky Poprad a i když teď voda teče jižním směrem, nakonec skončí daleko na severu ve Wisle a Baltu.